既然种植有机咖啡有这些缺点，为什么还要种植？两个主要原因：商业上的利益和环境因素。
有机咖啡的销售价格高于非有机咖啡，这些溢价可以抵消认证的成本，但也是一种适度的策略，可以在咖啡期货价低廉的情况下，让咖啡农可以有更多获利。以公平贸易条款出售的咖啡如果同时是有机认证，将自动获得每磅30美分的溢价。
有机咖啡的市场前景很难衡量，经过认证的有机咖啡并不是集中销售的，因此很难追踪售出后的状况。2011年至2016年美国有机贸易数据报告指出，美国有机咖啡的进口和价格基本上是稳定的，近年来却逐渐减少。但2018年关于可持续市场的报告指出，全球致力于有机生产的土地面积范围正在增加。
追根究柢，农民要自己决定有机认证在财物部分是否值得投入，透过了解认证内容，实际花费成本，并考虑是否可以与合作社合作让认证负担轻一些。
对许多人来说，进行有机认证的决定不仅是现实面的经济考量。Juan表示文章前面提到的巴西咖啡栽种区有意愿摆脱「传统咖啡和不稳定的纽约期货交易」，而改变的首选就是有机栽种，一方面符合当地人的生活哲学，也就是在微型气候产区进行永续生产。
在气候变迁的时代，农民和消费者越来越意识到使用非有机方法带来的影响。有机农业对土壤健康以及生态系统有一系列的正面影响，当中包括碳储存。
而且，正如 文章指出：「不正确的存放杀虫剂、施药者不充分的个人防护、以及缺乏对杀虫剂处理者的培训，这些情况在发展中国家并不罕见，导致农场工人直接暴露于毒素之下。」
对于烘豆师而言，道德伦理和经济方面也是需要考虑的主要因素。如果有机认证机构允许你在店里有机咖啡名号销售，那么前端的认证会需要更付出更多努力。
栽种有机咖啡可能是一个具挑战性且高风险的决定，认证成本会给生产者带来沉重的负担。但是，如果你倾向于永续农业，那么有机栽种对环境和健康的好处可能会对你很有吸引力。它也可能让你在市场上更好卖，因为拥有一个认证过的优质产品。
为有机咖啡建立完整的供应链并不是一件简单的事。必须考虑到供应链每个工作环节，令人惊讶的是，消费者最终在采买有机咖啡时每磅价格其实也不高。
